奇門遁甲在八卦與時間方位的配比上，基本是來源於後天八卦圖的，但是也有一些不同的地方：
一、周易的古典筮法，京房弄的納甲筮法，邵雍弄的梅花易數這些方法，都是用的後天八卦方位，就是北方坎、東北艮卦、東方震、東南巽
、南方離卦、西北坤、西方兌、西北乾卦這樣，在這一點上，奇門遁甲跟其他的這幾種是一樣的。
但是數呢，其他的幾種用的是先天數，就是幹一坎二艮三震四巽五離六坤七兌八這樣對應，而奇門遁甲用的卻是洛書九宮對應的後天八卦數
，也就是坎一、坤二、震三、巽四、中五、幹六、兌七、艮八、離九。
後天八卦圖在奇門遁甲中是怎么用的？
二、上面說的幾種筮法，所用的後天八卦方點陣圖與時間的關係：
北方坎：農曆十一月，大雪、冬至2個節氣，一天中子時
東北艮：農曆十二月、正月，小寒、大寒、立春、雨水4個節氣，一天中丑時、寅時
東方震：農曆二月，驚蟄、春分2個節氣，一天中卯時
東南巽：農曆三月、四月，清明、穀雨、立夏、小滿4個節氣，一天中辰時、巳時
南方離：農曆五月，芒種、夏至2個節氣，一天中午時
西南坤：農曆六月、七月，小署、大署、立秋、處署4個節氣，一天中未時、申時
西方兌：農曆八月，白露、秋分2個節氣，一天中酉時
西北幹：農曆九月、十月，寒露、霜降、立冬、小雪4個節氣，一天中戌時、亥時
而奇門遁甲中呢，八卦所對應的一天的時間是和上面幾種一樣的，但是對應24節氣的話就跟其他幾種略有不同。它是根據冬至一陽生，夏至一陰生，以這倆節氣為分解線，一個卦對應三個節氣，原來坎卦是對應大雪冬至，在奇門遁甲就變成了冬至開始的三個節氣，這樣平均分了，而在時間山就不是每卦對應一個月或二個月了，而是一個卦對應大致45天。三、由於上面說的原因，所以把八卦的陰陽屬性和干支的陰陽屬性也作了調整，造成了與其他幾種筮法的不同。周易中，幹坎艮震是代表父親、中男、少男、長男，因為男子為陽性，所以稱為四陽卦；巽離坤兌呢，代表長女、中女、母親、少女，女子為陰性，所以稱為四陰卦。
而奇門遁甲中跟，四陽卦是對應陽盾四卦的坎、艮、震、巽；四陰卦則是離、坤、兌、幹。
十個天干呢，則是前五個為陽，後五個為陰。